Logiciel SutterPatch
Le logiciel SutterPatch® est une application complète d’acquisition, de gestion et d’analyse de données d’électrophysiologie pour les ordinateurs Windows ou Mac OS
SutterPatch® est livré avec tous les systèmes d’amplificateur Sutter Instrument Patch Clamp
Le logiciel contrôle l’acquisition de données, fournit des mesures en temps réel pour faciliter la prise de décision pendant l’expérience, garde une trace de tous les paramètres de l’amplificateur, enregistre les progrès expérimentaux et stocke jusqu’à 600 paramètres de métadonnées
Construit dans la dernière version d’Igor Pro par WaveMetrics, Inc., SutterPatch offre un accès immédiat aux puissants outils d’analyse scientifique et technique d’Igor
Caractéristiques :
Une attention particulière a été accordée pour une navigation intuitive et facile à travers de grands ensembles de données.
L’architecture structurée des fichiers de données a été conçue pour conserver le contexte de chaque échantillon au sein d’une expérience. Avec peu d’effort en début d’une expérience, une pléthore de paramètres de métadonnées sont enregistrées - automatiquement si possible, configuré par l’utilisateur si désiré. Chaque paramètre peut être examiné avant l’exécution d’un paradigme ou d’une routine
Le logiciel SutterPatch est livré avec une collection d’exemples de paradigmes et de routines qui facilitent la configuration de scénarios expérimentaux couramment exécutés
SutterPatch® est doté d’une capacité d’analyse en temps réel qui crée automatiquement des graphiques comme les courbes I-V ou une fenêtre de parcours temporel pendant que l’expérience est en cours. Jusqu’à 8 graphiques d’analyse peuvent être montrés, chacun dérivé de 16 mesures possibles à partir des signaux d’entrée. Les analyses comprennent la moyenne, la pente, le temps d’élévation, la fréquence du franchissement du seuil, etc. Cela facilite la prise de décisions quant à la poursuite d’une expérience
En plus de l’analyse en temps réel, SutterPatch® prend en charge un traitement ultérieur après l’expérience pour les procédures d’analyse les plus sophistiquées. SutterPatch® ajoute des fonctionnalités spécifiques à l’application, en plus de l’ensemble de fonctionnalités d’analyse étendue qui est originaire d’Igor Pro. Les équations et les variables facilitent l’utilisation d’algorithmes plus complexes dans les routines et les paradigmes
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Prise en charge de tous les systèmes d’amplificateur, d’instruments Sutter, y compris le nouveau système de patch clamp numérique dPatch®
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Scope Window fournit une navigation intuitive et efficace au travers de vos données
- Boutons de contrôle de zoom et curseurs
- Faire glisser le long de l’axe pour zoomer
- Zoom de roue de souris
- Zoom de marque
- Barres de défilement
- Auto-échelle continue et instantanée
- Balayage, cours de temps et affichage en ligne
- Nouvel écran 3D
- Navigateur d’aperçu unique pour l’examen panoramique et le mouvement pratique dans une section de données
- La fenêtre Paradigm Review donne un accès rapide aux données de routine individuelles
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Le test de membrane garde une trace de l’état cellulaire et d’autres paramètres de contrôle de qualité
- Les types de forme d’onde comprennent les impulsions doubles, les trains sinusaux et triangulaires et la mesure instantanée du bruit RMS
- Affichage simultané d’un amplificateur ou d’un signal d’entrée auxiliaire et d’une forme d’onde de commande
- Paramètres de stimulation entièrement configurables
- Moyenne des impulsions
- Moniteur audio
Autres caractéristiques :
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Les routines contrôlent l’acquisition de données
- Exemple de pool de routine avec paradigmes pré-configurés pour de nombreuses applications courantes
- Les signaux câblés du matériel Sutter Instrument et les signaux d’entrée auxiliaires sont enregistrés
- Le signal de commande appliqué à la cellule est surveillé et enregistré
- Les signaux de sortie analogique et numérique contrôlent la périphérie et l’information de tiers
- Jusqu’à 50 segments par balayage pour une grande flexibilité dans la formation des profils de stimulations les plus complexes
- Formes de segment pré-configurées telles que Sine, Square et Chirp pour une conception facile de profils de stimulations
- Waveform Template permet la « lecture » d’un signal assigné à une cellule ou l’application d’une expression mathématique comme forme de stimulation
- Les mesures constituent la base d’une analyse en temps réel et permettent la prise de décision au cours de l’expérience
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Les paradigmes permettent l’automatisation des processus et éliminent les biais de l’opérateur
- Exemple avec paradigmes pré-configurés pour de nombreuses applications courantes
- Configurer l’amplificateur aux réglages standard reproductibles
- L’acquisition de séquences de routine permet l’expérimentation pré-planifiée et minimise les biais de l’opérateur
- Contrôle des flux pour la prise de décision interactive ou automatisée pendant l’expérience
- Chaining Paradigms offre une flexibilité supplémentaire
- Création automatique de présentation pour la documentation standardisée
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L’éditeur de solutions permet de suivre les solutions et les composés et prend en charge le contrôle direct d’un commutateur de solution
- Les conditions initiales et tous les changements de solution sont automatiquement écrits sur le MetaData
- Les sorties analogiques ou numériques contrôlent tous les commutateurs de solutions courants
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Le navigateur de données affiche l’expérience entière dans une structure arborescente
- Aperçu du premier signal acquis
- Accès rapide à Paradigm Review, Reanalysis Scope, Metadata et Informations de routine
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Analyses en temps réel et hors ligne, y compris la détection d’événements mini/synaptiques et la caractérisation et l’analyse des potentiels d’action
- Les mesures configurées dans le cadre des routines créent des graphiques en temps réel
- Les signaux virtuels fournissent à l’utilisateur des informations dérivées de signaux d’entrée physiques, d’équations mathématiques, de modification du signal ou de toute combinaison de ceux-ci. Les filtres à haut seuil et à bas seuil, la capacité d’amplificateur de verrouillage et la soustraction d’un balayage de référence sont nouveaux dans la version 2
- Les paradigmes peuvent accéder à des mesures pour une analyse en temps réel plus poussée
- Les équations et les variables offrent la plus grande flexibilité
- Détection d’événements à l’aide d’un algorithme à déconvolution performant
- Exporte facilement des données vers Microsoft Excel et d’autres programmes de feuilles de calcul pour la compatibilité avec les procédures d’analyse existantes
- Une multitude de caractéristiques d’analyse Igor Pro natives
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Prise en charge du mode multi-amplificateur IPA
- Combinaison possible de deux amplificateurs IPA® ou Double IPA®
- Jusqu’à 16 canaux d’entrée sont pris en charge
La version 2 du logiciel SutterPatch ® ajoute un support pour le nouveau système d’amplificateur de patch numérique ainsi qu’une multitude de nouvelles fonctionnalités et d’améliorations de l’interface utilisateur qui s’appliquent également à la famille IPA de systèmes d’amplificateur. Le Test Membrane et free Run ont été améliorés. Les nouveaux contrôles triple curseur et matrice 2D facilitent les ajustements de numérotation dans le panneau de contrôle de l’amplificateur.